Uznanie przez Światową Organizację Zdrowia in vitro za metodę leczenia niepłodności wzbudziło nie mniejsze kontrowersje niż procedura sama w sobie. Niektórzy sceptycy uważają bowiem, iż nie jest to sposób na leczenie czegokolwiek. Według nich in vitro pozwala obejść przeszkodę, jaką jest niepłodność, natomiast nie usuwa jej (czego wymaga się zawsze od metod będących leczeniem danych przypadłości). Tymczasem naukowcy wskazują, iż twierdzenie, że sztuczne zapłodnienie niczego nie leczy, nie jest do końca prawdziwe. W niektórych przypadkach kuracja hormonalna poprzedzająca zabieg oraz pomyślne przejście ciąży i porodu powodują, że w przyszłości pacjentka jest w stanie zajść w ciążę w sposób naturalny. Oczywiście zależy to od przyczyny niepłodności, ponieważ bardzo często jest ona nieusuwalna.